Агенцията е структура на пряко подчинение на министъра на отбраната по чл. 78 от Закона за отбраната и въоръжените сили на Република България за административно обслужване на военнослужещи и цивилни служители от Министерството на отбраната, структурите на пряко подчинение
Координацията и контролът на дейността в областта на железопътния транспорт се осъществяват от Изпълнителна агенция "Железопътна администрация" със седалище София и с териториални звена.
Изпълнителната агенция "Железопътна администрация" изпълнява функциите на регулаторен орган в
Изпълнителната агенция по сортоизпитване, апробация и семеконтрол (ИАСАС) е юридическо лице със седалище София - второстепенен разпоредител с бюджетни средства към Министерството на земеделието и храните. Министърът на земеделието и храните осъществява държавната политика в областта на
Изпълнителната агенция по лозата и виното (ИАЛВ) е създадена на основание чл. 66, ал. 2 от Закона за виното и спиртните напитки. Aгенцията осъществява контрол по спазването на изискванията на Закона за виното и спиртните напитки по отношение на лозовите насаждения, гроздето, предназначено
Изпълнителната агенция по трансплантация е компетентният орган за управление, координация и контрол на трансплантацията в Република България.
Агенцията е юридическо лице на бюджетна издръжка със седалище София и е второстепенен разпоредител с бюджетни кредити към министъра на
Агенцията по обществени поръчки е създадена на 12.03.2004 г. с Постановление № 56 на Министерски съвет (обн. ДВ, бр. 24 от 23.03.2004 г.) съгласно Закон за обществените поръчки в сила от 01.10.2004 г., който предвижда създаването на самостоятелна административна структура в тази област.
Националният институт за помирение и арбитраж е създаден с изменението и допълнението от 2001 г. на Закона за уреждане на колективните трудови спорове. Той е юридическо лице към министъра на труда и социалната политика със седалище в София и с ранг на изпълнителна агенция. Институтът е
Изпълнителната агенция по околна среда